内容简介
miRNA靶基因的鉴定对miRNA工作机制的理解至关重要，但由于缺乏有力的实验手段和高准确度的预测算法，靶基因的鉴定已经成为miRNA研究的瓶颈问题。本书首先建立了转录因子调控基因集以及转录因子上游基因网络数据库；其次利用GSEA分析miRNA过表达实验中有明显富集度变化的转录因子；最终追溯这些转录因子上游的基因并与SVMicrO预测结果进行交迭，给出预测结果。评估结果表明，SysMicrO不仅可以有效地对SVMicrO的预测结果进行筛选从而提高特异度，还可以给预测结果提供相关注释信息和生物学解释，为后续的分析和鉴定提供合理的建议。